MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 plasmid pLBUC02

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015429	TATT	2	8	108	115	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015429	GTT	2	6	118	123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015429	ATTA	2	8	246	253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015429	TTTA	3	12	254	265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015429	CCT	2	6	1346	1351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_015429	TAG	2	6	1374	1379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015429	AAAT	2	8	1382	1389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015429	AAAC	2	8	1390	1397	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015429	TTA	2	6	1401	1406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015429	AAT	2	6	1407	1412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015429	TAGCA	2	10	2075	2084	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015429	ATT	2	6	2142	2147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015429	CTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015429	ATT	2	6	2272	2277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015429	T	6	6	2276	2281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015429	GTT	2	6	2329	2334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015429	TGT	2	6	2365	2370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015429	GATT	2	8	2384	2391	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015429	A	6	6	2406	2411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015429	AAT	2	6	2422	2427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015429	TAA	2	6	2484	2489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015429	TAT	2	6	2507	2512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015429	AT	3	6	2521	2526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015429	GAT	2	6	2568	2573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015429	GTA	2	6	2617	2622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015429	GA	3	6	2713	2718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015429	GAA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015429	CAA	2	6	2817	2822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015429	GTC	2	6	2890	2895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015429	GAT	2	6	2953	2958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015429	TCA	2	6	3002	3007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015429	TTC	2	6	3103	3108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015429	GCG	2	6	3147	3152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015429	CTT	2	6	3159	3164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015429	TGT	2	6	3176	3181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015429	AGC	2	6	3190	3195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015429	CG	3	6	3287	3292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015429	GAA	2	6	3324	3329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015429	TCGAG	2	10	3434	3443	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_015429	CAG	2	6	3530	3535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015429	GTT	2	6	3575	3580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015429	TAGC	2	8	3639	3646	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015429	GTC	2	6	3684	3689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015429	ATT	2	6	3725	3730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015429	AT	3	6	3781	3786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015429	CGT	3	9	6206	6214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015429	TAC	2	6	6292	6297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015429	TC	3	6	7123	7128	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015429	ATT	2	6	9015	9020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015429	TTGG	2	8	9984	9991	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015429	CTA	2	6	9998	10003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015429	ATTA	2	8	10046	10053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015429	ACC	2	6	10084	10089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_015429	A	6	6	10098	10103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015429	CATAC	2	10	10139	10148	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_015429	TCA	2	6	10163	10168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015429	AAC	2	6	11424	11429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015429	TGA	2	6	11518	11523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015429	AAG	2	6	11555	11560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015429	AAT	2	6	11726	11731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015429	TTA	2	6	11754	11759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015429	CAA	2	6	11765	11770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015429	GTTC	2	8	11771	11778	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015429	CAG	2	6	11802	11807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015429	CATG	2	8	11833	11840	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015429	AAAG	2	8	11849	11856	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015429	AAG	2	6	11861	11866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015429	AAG	2	6	11895	11900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015429	GTTC	2	8	12557	12564	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015429	T	6	6	12640	12645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015429	CAC	2	6	14720	14725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015429	TGT	2	6	14753	14758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015429	TCA	2	6	14806	14811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015429	TCT	2	6	14852	14857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015429	TTAACT	2	12	14865	14876	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015429	GAT	2	6	14949	14954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015429	TTA	2	6	16364	16369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015429	ATTT	2	8	16370	16377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015429	C	6	6	16684	16689	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
80	NC_015429	TAC	2	6	16695	16700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015429	CTT	2	6	16742	16747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015429	TA	3	6	16883	16888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015429	CCA	2	6	16957	16962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_015429	TAA	2	6	17023	17028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015429	AC	3	6	18201	18206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015429	GTC	2	6	18207	18212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015429	AG	3	6	18217	18222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015429	T	7	7	18355	18361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015429	AAC	2	6	18369	18374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.